Lauréat 2013 Bourse Marie Curie IOF Programme OCEANCHArCoT
Membre du Réseau Francophone de Métabolomique et de Fluxomique
Membre de l'Association Francophone pour l'Enseignement et la Recherche en Pharmacognosie
Membre de l'American Society of Pharmacognosy
Membre de l'Association for the Sciences of Limnology and Oceanography
Reviewer pour les journaux Marine Drugs et Algal Research
Invité au congrès Végétaux aquatiques : écologie et bénéfices (Porquerolles, octobre 2013)
Conférencier invité au 5ème Congrès International des Biotechnologies
(Valence, Espagne, Juin 2014)
En quelques mots :
Volontaire, passionné et sensible au respect des valeurs humaines, je souhaite mettre mes compétences au service de la recherche de molécules à haute valeur ajoutée issues de la biodiversité marine.
Domaine d'intérêt :
A l'interface entre l'océanographie biologique et la pharmacognosie marine
Palme d'or du superviseur érudit, bienveillant et intègre décernée à :
Prof. Ronald J. QUINN (Griffith Institute for Drug Discovery, Brisbane, Australie)
Mentor inspirant :
Prof. émérite Jean-Michel KORNPROBST (Université de Nantes)
Griffith Institute for Drug Discovery - Griffith University
Juillet 2014
à août 2016
CDD
Brisbane
Australie - Queensland
Programme OCEANCHArCoT : OCEAN CHemodiversity Against Cell Cycle Targets
Production de fractions marine optimisées "drug like"
Évaluation d'activité biologique de fractions issues d'organismes de le grande barrière de corail australienne
Déréplication de signatures RMN de fractions marines
Aim: Research of new marine inhibitors targeted against desease-relevant proteins kinases
These latter are involved in various human pathologies such as cancer, neurodegenerative diseases or can be targeted to alter the life cycle of various parasites such as those responsible neglected parasitic diseases such as leishmaniasis and malaria. There are no physiological events not involving significant changes in protein phosphorylation. Therefore, PKs constitute currently the first class of targets used by pharmaceutical companies for the characterization of novel bioactive compounds. In a project intended to exploit the ocean biodiversity, Jean-Baptiste Charcot (1867-1936), a pioneer in oceanography established large collections of marine organisms. Taking this one step further, my project aims to source marine crude extracts from the Nature Bank collection (QLD, Australia), and from the unique Roscoff Culture Collection of microalgae (France) to identify new PK inhibitors. We will focus our analysis on PKs involved in the control of the cell division cycle (CDKs, TLKs and mitotic kinases such as Haspin and Auroras). The cellular effect of the selected inhibitors will be analysed on various cancer cell lines. This project will benefit from a new cutting edge technology will be used for the early screening of marine chemodiversity: bioaffinity (focused on PKs) mass spectrometry with a Bruker SolariX 12 Tesla FTMS. The lead-like enhanced fractions will be tested against various disease models and dereplicated in order to quickly identify bioactive molecules. Hit fractions will be produced in larger quantity before purification, characterization and pharmacological evaluation. In conclusion, OCEANCHArCoT will contribute, from Australia to France, to the research of marine bioactives to discover new therapeutic avenues to fight growing medical and social burdens such as cancer and Alzheimer’s disease.
IFREMER-Laboratoire Physiologie et Biotechnologie des Algues
Mars 2009
à décembre 2012
CDD
Nantes
France
Laboratoire dédié principalement aux applications biotechnologiques des microalgues ainsi qu'à l'étude de leur métabolisme
Recherche et production de métabolites d'intérêt en photochimiothérapie dynamique issus de micro-organismes photosynthétiques (travaux sous clauses de confidentialité)
Culture de microalgues et de cyanobactéries
Développement d'un biotest pour évaluer le potentiel d'intérêt visé en vue d'un criblage haut débit
Comparaison de méthodes de broyage cellulaire par la méthodologie des plans d'expériences
Optimisation d'extraction des molécules cibles
Développement de la déréplication des molécules cibles au moyen d'un couplage CLHP-UV DAD
Purification par chromatographie liquide haute performance
Analyse d'image
Cytométrie en flux
Valorisation de molécules par brevet en cours
Valorisation dans Bioresource Technology 124 : 311-320 (Serive et al, 2012)
Analyses pigmentaires de souches de Isochrysis afinis galbana pour l'équipe Algue & Génome du laboratoire PBA (IFREMER)
Comparaisons pigmentaires de souches de dinoflagellés pour le laboratoire de phycotoxines (IFREMER)
Étude pigmentaire d'un Glaucophyte
Composition pigmentaire de 45 souches de micro-organismes photosynthétiques
Enzymologie, biochimie, biologie moléculaire, chimie bio-organique, intégration des voies métaboliques Projet de recherche tutoré : Optimisation du procédé d’immobilisation d’une beta-galactosidase issue de Bacillus circulans en vue de son exploitation en bioréacteur
Océanographie physique et biologique, zoologie marine, algologie, aquariologie, géologie marine, halieutique, aquaculture Étude biblio-technique : Méthodes de récolte et de tri des œufs en pisciculture marine Étude bibliographique : L'hydrothermalisme marin Projet de recherche tutoré : Étude des conditions de maintien et de culture de macroalgues pour décorer un aquarium marin d’espèces locales
Veille scientifique et technologique (base de brevets)
Études par plans expérimentaux (criblage de facteurs et optimisation)
Analyses statistiques des données (Statgraphics, Xlstat, Matlab)
Élaboration et gestion de projet (Diagramme de Gantt, Mind Mapping sur Mindmanager, devis, gestion des stocks)
Rédaction de cahier des charges
Reporting des résultats
Collaborations avec des laboratoires extérieurs (IFREMER Brest, LEMAR, CHU Nantes, Institut de Chimie de Nice, plateforme BIODIMAR Brest, Laboratoire de Phycotoxines Nantes)
Publications dans journaux à comité de lecture
Réseautage scientifique
Vulgarisation scientifique (Journée Mondiale des Océans, Square des Sciences, Fête de la Science, sortie estran)
Study on the microalgal pigments extraction process: performance of microwave-assisted extraction (2011) Process Biochemistry 46: 59-67
Antiproliferative activity of violaxanthin isolated from bioguided fractionation of Dunaliella tertiolecta extracts (2011) Marine Drugs 9: 819-831
Selection and optimisation of a method for efficient metabolites extraction from microalgae (2012) Bioresource Technology 124: 311-320
Screening marine resources to find novel chemical inhibitors of disease-relevant protein kinases (2015) Medecine/Sciences 31(5): 538-545
Community analysis of pigment patterns from 37 microalgae strains reveals new carotenoids and porphyrins characteristic of distinct strains and taxonomic groups (2017) PLoS One 12(2): 1-35
Constituents of Acacia nilotica (L.) Delile with novel kinase inhibitory activity (2017) Planta Medica International Open 4:108-113
Marine pigment diversity: applications and potential (2018) In: Blue Biotechnology: production and use of marine molecules
Microalgal biomass of industrial interest: methods of characterization (2020, in process) In: Biomass, waste and related by-products characterization